SHELL 을 이용한 CRON 을 이용해서 만드는 방법이 있구요
( 여러가지 방법이 공개 되어 있습니다 )
phpMyAdmin 이라는 PHP 로 된 공개 웹 툴(소스) 가 있습니다.

[phpMyAdmin]----------------------------------

PHP 개발자들이 많이 사용하는 편이기도 하구요

http://www.phpmyadmin.net/home_page/index.php

에서 다운받으실수 있습니다.

[ SHELL 을 이용하는 방법 ]----------------------------------

이뉴엔도 님의 글 발췌 하였습니다.

#!/bin/sh

################################# 개요 ##############################
# 인자로 들어온 server1의 특정 db를 백업한다
# 인자가 생략되면 test_db 이다.
# split로 분할 압축후 server2의 /home/myid/test_db 에 ftp로 전송한다

# 파일명 : "db명"_"날짜"_"aa" ...
# 첫번째 인자: db명, 생략하면 test_db
###################################################################



############## 필요한 변수들 ##############
host="server2.test.com"
username="myid"
password="mypasword"

db_name=${1:-test_db}
mysql_dir="/home/mysql/data/"
backup_dir="/tmp/pieces/"
today_date=`date +%Y%m%d`
size="650m"

#########################################

# 기존에 만들어진 파일들을 없앤다
# /tmp/pieces 로 이동후 원하는 db 디렉토리를 분할압축 한다.
# ftp로 server2 의 /home/myid/test_db 로 옮긴다.



echo "[`date +%Y-%m-%d\ %T`] $db_name backup Start !!!"
if [ -d "$backup_dir" ]; then
    rm -f ${backup_dir}*
fi

cd $backup_dir
tar cf - ${mysql_dir}${db_name} | gzip -c | split -b $size - ${db_name}_${today_date}_


{
    echo user $username $password
    echo cd /home/myid/test_db
    echo lcd /tmp/pieces
    echo prompt
    echo mput *
    echo quit
} | ftp -n $host 21

echo "[`date +%Y-%m-%d\ %T`] $db_name backup End !!!"
exit 0